分享一篇发表在Nature Communications上的文章，文章的题目为“Acoustice jection mass spectrometry empowers ultra-fast protein biomarker quantification”，通讯作者为比利时根特大学药物生物技术实验室的Maarten Dhaenens教授和洛杉矶雪松-西奈医学中心高级临床生物系统研究所的Jennifer E.Van Eyk教授，其中Maarten Dhaenens的研究方向是蛋白质组学和质谱，Jennifer E.Van Eyk的研究方向是临床蛋白质组学。
COVID-19的大规模爆发，使研究人员意识到开发高通量的蛋白质组学生物标志物检测方法的必要性。目前对于复杂生物样品中的蛋白质定量，非靶向蛋白质组学技术是高选择性的普适方法，配备标准自动化样品制备技术后，一个样本的检测时间为1 min，但对于大队列样本来说，实现快速、精确的定量仍然十分困难。此前，COVIDPro收集了血浆蛋白质组的生物标志物，发现病毒侵染后，某些急性时相反应蛋白（APR）发生变化，此外几种表征SARS-CoV-2疾病严重程度的蛋白质标志物趋势一致，差异突出。因此作者希望通过对这些特定的生物标志物进行靶向检测，从而扩大样本数至数万或数十万。除了血浆生物标志物，研究者也开发了鼻咽拭子的筛查方法。鼻咽拭子的储存介质较为复杂，直接定量病毒肽非常具有挑战性。因此，免疫亲和富集被应用于样品制备过程中，以提升靶向分析的灵敏度。基于LC-MS的方法需要色谱分离，因此限制了通量，在此研究中，多肽免疫富集和声喷射质谱（AEMS）技术相结合，无需LC分离，为超快速生物标志物筛选提供了可能。本文中，作者提出了一种基于AEMS的定量分析方法，使用肽免疫捕获富集血浆中的10个APR蛋白标记物和鼻咽拭子中的SARS-CoV-2 NCAP肽。作者在267份血浆样本中进行APR蛋白标记物定量，在4.8 h内完成3次重复，变异系数从4.2%到10.5%。此外，作者从145个病毒拭子样本中检测SARS-CoV-2肽，在10 min内完成三次重复定量。该检测方法比LC-MS的速度提高了15倍，在10,000个肽测量中显示了仪器的稳定性。AEMS的速度和肽免疫捕获选择性的结合使得在非常大的队列中进行超高通量、可重复性的定量生物标志物筛选成为可能。文章链接：
https://www.nature.com/articles/s41467-024-48563-z
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