Angew. Chem. :史无前例的羟吲哚堆积多晶型:晶体结构预测所启发的探索

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多晶型是同一分子可以存在不同的晶体排列方式的现象。因为不同多晶型可以表现出各异的物理化学性质,进而直接影响药物的吸收与疗效。发现和表征多晶型是一项复杂而耗时的任务,实验观察到的多晶型数量也因分子而异。此外,“消失”的多晶型,即最初观察到的晶型无法实验再现的现象,对制药行业构成了重大挑战。


近日,默沙东的朱霄龙博士和Alfred Y. Lee博士的研究团队将晶体结构预测、自由能计算与前沿的结晶技术相结合,更加全面系统地构建多晶型,并有效地再现“消失”的多晶型。此外,这些结果还为刚性分子的堆积多晶型建立了新的记录。

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作者选择羟吲哚作为模型系统,此化合物有已知的四种多晶型(α、β、γ和δ),其中δ是之前报道中无法实验再现的“消失”的晶型。此外,这是一种小型而刚性的分子,这意味着晶型的变化只受到分子排列方式的影响,而不是分子构象的变化。


采用晶体结构预测,作者通过将预测的结构与已知的实验晶型进行比较,评估了羟吲哚的晶型能量分布和热力学稳定性。随后,作者进行了熔融、溶液和纳米尺度的结晶。这些实验成功构建了已知的四种晶型,包括“消失”的δ晶型,并且发现了四种新的多晶型(ε、ζ、η和θ)。

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所有多晶型的单晶由不同的方法成功制备。X射线解析了多晶型结构,并揭示了晶体中三种不同的氢键网络。自由能的计算深入研究了各个晶型能量随温度变化的情况,并且计算结果与转晶和热力学分析的实验数据完全吻合。

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这项工作通过计算和实验的结合不仅为实现“消失”的多晶型有针对性的结晶提供了方法和机制的深入见解,还发现了羟吲哚的新的四种多晶型。这为刚性分子的堆积多晶型确立了新的记录,强调了即使是简单分子也可能拥有多样且复杂的多晶型现象,更加凸显了多晶型的系统筛选与评估在药物研发中的重要性。

文信息

Unprecedented Packing Polymorphism of Oxindole: An Exploration Inspired by Crystal Structure Prediction

Emily J. Wu, Andrew W. Kelly, Luca Iuzzolino, Alfred Y. Lee, Xiaolong Zhu


Angewandte Chemie International Edition

DOI: 10.1002/anie.202406214


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