推荐一篇发表在PNAS上的文章，题目为“Oncogenic IDH1mut drives robust loss of histone acetylation and increases chromatin heterogeneity”，通讯作者是来自以色列魏茨曼科学研究所的Efrat Shema教授，研究方向主要是开发单细胞技术分析癌症组织中的表观遗传学。
恶性胶质瘤中异柠檬酸脱氢酶IDH突变较为普遍，往往会导致α-KG转变为2-HG，由于影响了胞内作为酶活辅因子的α-KG的含量，导致组蛋白高甲基化的表型。本文利用基于CyTOF技术的单细胞表观遗传学，在单细胞分辨率下系统地描述了突变型IDH1表达对胞内组蛋白甲基化及乙酰化修饰的影响。本文作者在不同的IDH1突变细胞系中均观察到大部分组蛋白的甲基化水平都明显升高，而几乎所有组蛋白的乙酰化水平都明显降低。而后，使用辛基-2-HG处理星形胶质细胞，并通过CyTOF分析，发现了高甲基化的表型，但除开H4K16ac之外，并未发现明显的乙酰化降低表型，说明了乙酰化的变化并非主要由2-HG驱动。随后，作者发现在IDH1突变细胞中与生成乙酰CoA路径中相关的基因表达都有明显改变。同时胞内乙酰CoA的水平有所降低，在加入IDH1mut抑制剂或者外源添加乙酸盐都能够适当恢复组蛋白的乙酰化，说明了这些细胞中的组蛋白乙酰化机制是完整的，由突变型IDH1驱动的组蛋白乙酰化缺失可能是由细胞乙酰CoA和醋酸盐可用性的变化引起的。在不同的细胞系上（HEK293细胞和胶质瘤MGG18细胞）进行实验，证实了该突变导致乙酰化修饰变化的普遍性。总的来说，本文通过单细胞表观遗传分析技术，揭示了IDH1突变细胞系中组蛋白甲基化和乙酰化水平的改变，探究了乙酰CoA合成通路改变对这一变化的影响。文章链接：https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2403862122原位引用：https://doi.org/10.1073/pnas.2403862122
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